Analyste spécialisé(e) en informatique (bio-informaticien(ne))

Analyste spécialisé(e) en informatique (bio-informaticien(ne))

Direction des services multidisciplinaires

Poste permanent à temps complet

Poste réservé exclusivement aux employés de Santé Québec

Description du mandat

Le Laboratoire de diagnostic moléculaire et de génétique des maladies cardiovasculaires héréditaires (LDM) de l'Institut de cardiologie de Montréal est un chef de file national en cardiogénétique. Son équipe de bio-informatique joue un rôle clé dans l'analyse des données génomiques issues du séquençage de nouvelle génération (NGS), contribuant directement au diagnostic, au traitement et à la prise en charge des patients atteints de maladies cardiovasculaires héréditaires.

Sous l'autorité de la direction du laboratoire et en collaboration avec une équipe multidisciplinaire du laboratoire, la personne titulaire du poste assure le traitement, l'analyse et l'optimisation des données génomiques produites par le laboratoire. Elle contribue également au développement et à l'amélioration continue des outils, des pipelines d'analyse bio-informatiques et des technologies de pointe soutenant les activités de génomique clinique. Par son expertise, elle participe activement à l'évolution des services offerts aux patients et au rayonnement du laboratoire dans un domaine en constante innovation.

Principales responsabilités

• Assurer l'exécution, la surveillance et l'optimisation des pipelines bio-informatiques de séquençage;
• Garantir la qualité, la fiabilité et l'intégrité des données génomiques analysées;
• Analyser les résultats de séquençage et produire les indicateurs de performance du laboratoire;
• Maintenir et faire évoluer les outils, applications et scripts bio-informatiques;
• Contribuer à la gestion, à la sécurisation et à l'optimisation des infrastructures et des données;
• Offrir un soutien technique spécialisé aux équipes du laboratoire;
• Réaliser une veille scientifique et technologique afin d'intégrer les meilleures pratiques et les innovations du domaine.

Au-delà de ses activités opérationnelles, la personne retenue participera activement au développement, à la validation et à l'implantation de nouvelles analyses et de nouveaux pipelines bio-informatiques. Elle contribuera ainsi au développement de la génomique clinique et à l'avancement de la médecine de précision au Québec, au sein d'un environnement innovant et à la fine pointe des technologies génomiques.

Exigences

• Baccalauréat en informatique ou en bio-informatique ou dans une discipline pertinente;
• Détenir une certification de spécialisation délivrée par une autorité compétente et reconnue dans le domaine des technologies de l'information, comme par exemple, une certification Linux (LPIC-1, LFCS ou équivalent) ou une certification Python (PCAP ou équivalent);
• Une maîtrise en bio-informatique, constitue un très fort atout;
• Expérience pratique de travail avec des données de séquençage de nouvelle génération (Next-Generation Sequencing [NGS] ou séquençage parallèle à haut débit [SPHD]) sur les plateformes Illumina (CRAM, BAM, VCF, FASTQ, ORA, JSON, etc.);
• Expérience pratique en programmation avec Python, R, Django, React, SQL, Java et HTML;
• Bonne connaissance des environnements Windows (suite Microsoft, notamment Excel) et Linux (ligne de commande);
• Connaissance des bases de données génétiques publiques;
• Connaissance des logiciels de gestion et de suivi des versions de scripts (Git, CVS ou SVN);
• Excellente maîtrise du français, tant à l'oral qu'à l'écrit;
• Bonne maîtrise de l'anglais, tant à l'oral qu'à l'écrit.

Conditions de travail

• Poste syndiqué à temps complet (35 heures par semaine);
• Travail en mode hybride;
• Taux horaire de 31,48 $ à 57,75 $, selon l'expérience;
• Conditions de travail et avantages sociaux conformément aux dispositions en vigueur.

Avantages

L'Institut de cardiologie de Montréal offre une vaste gamme d'avantages visant la santé, le bien- être et la qualité de vie au travail des employés, dont l'accès gratuit au Centre ÉPIC, aux cabines Recharjme et aux salles de silence, ainsi que divers autres avantages.

Pour soumettre votre candidature :

Si cette opportunité de carrière vous intéresse, nous vous invitons à soumettre votre candidature en ligne en cliquant sur " Postuler " et à joindre les documents requis, soit votre lettre d'intention et votre curriculum vitæ.